В 2001 г. Департамент по охране и развитию охотничьих ресурсов МОХ РФ откликнулся на просьбу Центра охраны дикой природы в оказании помощи в мероприятиях по учету выхухоли по субъектам Российской Федераций, где в прошлом обитала русская выхухоль. Для этого была разработана анкета, на основании которой и осуществлялся сбор первичного материала. Анкеты были разосланы по 25 областям и республикам России. Учетом было охвачено около 30 тыс. км, береговых рек, озер и искусственных водоемов. Это самый масштабный учет выхухоли за последние 30 лет. Он осуществлялся по единой методике.
Учет заключался в подсчете жилых нор на 1 км, береговой линии водоема. Анализ первичного материала показал, что в местах обитания выхухоли практически всюду отмечалась ондатра. Поэтому пересчетный коэффициент на 1 нору брали 0,6 зверька, как до льда, так и по льду (Кудряшов, 1976).